Для проведення податкового контролю платники податків підлягають постановці на облік у податкових органах за місцем перебування організації, місцю знаходження її філій і представництв, місцю проживання фізичної особи, а також за місцем перебування приналежного їм нерухомого майна й транспортних засобів, що підлягають оподатковуванню.
Організація, до складу якої входять філії й представництва, розташовані на території РФ, а також у власності якої перебуває підмет оподатковуванню нерухоме майно, встають на облік як налогоплательщика в податковому органі як по своєму місцю знаходження, так і за місцем перебування кожної своєї філії й представництва й місцю знаходження приналежного їй нерухомого майна й транспортних засобів.
Кожному платникові податків привласнюється єдиний по всіх видах податків і зборів, у тому числі підметів сплаті у зв’язку з переміщенням товарів через митний кордон РФ, і на всій території РФ ідентифікаційний номер платника податків.
Кожен платник податків указує свій ідентифікаційний номер у подавані в податковий орган декларації, звіті, заяві й т.п.
На основі даних обліку Міністерство РФ по податках і зборам веде Єдиний державний реєстр платників податків.
Податкові органи проводять камеральні або виїзні податкові перевірки. Камеральні податкові перевірки можуть проводитися відносно всіх налогоплательщиков, виїзні - відносно організацій й індивідуальних підприємців. Податковою перевіркою можуть бути охоплені не більш ніж три календарних роки діяльності платника податків, що передували року проведення перевірки.
Якщо при проведенні камеральних і виїзних податкових перевірок у податкових органів виникає необхідність одержання інформації про діяльність платника податків, пов’язаної з іншими особами, податковим органом можуть бути витребувані в цих осіб документи, що ставляться до діяльності налогоплательщика, що перевіряє. Це так називана зустрічна перевірка.
Запрещается проведення податковими органами повторних виїзних податкових перевірок за тим самим податками, що підлягають сплаті або сплаченому платникові податків за вже перевірений податковий період, крім випадків, коли така перевірка проводиться у зв’язку з реорганізацією або ліквідацією организации-налогоплательщика або вищестоящим податковим органом у порядку контролю за діяльністю податкового органа, що проводив перевірку.