Фонд установлює для страхових медичних організацій єдині нормативи фінансових фондів і резервів у відсотках до фінансових коштів, переданим їм на проведення обов’язкового медичного страхування. При цьому сума коштів у запасному резерві не повинна перевищувати одномісячного, а в резерві фінансування попереджувальних заходів - двотижневого запасу коштів на оплату медичної допомоги в обсязі територіальної програми обов’язкового медичного страхування. Фонд установлює порядок використання страховими медичними організаціями фінансових резервів і фондів.
Резерв оплати медичних послуг — це фінансові кошти, формовані страховою медичною організацією для оплати майбутньої медичної допомоги застрахованим. Кошти резерву оплати медичних послуг призначені для оплати протягом дії договорів страхування медичних послуг, зроблених застрахованому контингенту в обсязі й на умовах територіальної програми обов’язкового медичного страхування.
По закінченні календарного року визначаються фінансові результати проведення обов’язкового медичного страхування, і у випадку перевищення доходів над витратами сума перевищення направляється на поповнення резервів і доходу страхової медичної організації.
Важливе значення для розвитку системи медичного страхування має Програма державних гарантій забезпечення громадян РФ безкоштовною медичною допомогою. Вона визначає види медичної допомоги, надаваної населенню безкоштовно. Фінансування Програми здійснюється за рахунок коштів бюджетів всіх рівнів, коштів обов’язкового медичного страхування й інших надходжень.
У рамках базової програми обов’язкового медичного страхування громадян РФ надається амбулаторно-поліклінічна й стаціонарна допомога в установах охорони здоров’я незалежно від їхньої організаційно-правової форми при інфекційних і паразитарних захворюваннях. Базова програма здійснюється за рахунок коштів обов’язкового медичного страхування. На основі базової програми органи виконавчої влади суб’єктів РФ розробляють і затверджують територіальні програми обов’язкового медичного страхування, обсяг надаваної медичної допомоги по яких не може бути менше обсягу, установленого базовою програмою.