Органи державної влади суб’єктів РФ здійснюють контроль за витратою коштів, що надійшли в місцеві бюджети з бюджетів суб’єктів РФ.
Федеральним законом про федеральний бюджет може бути передбачена фінансова допомога місцевим бюджетам на фінансування цільових витрат, передбачених федеральними цільовими програмами або федеральними законами. Органи державної влади суб’єктів РФ здійснюють контроль за витратою коштів, що надійшли в місцеві бюджети з бюджетів суб’єктів РФ.
Формування бюджету закритого адміністративно-територіального утворення (ЗАТЕ) має свої особливості:
1) у доходи бюджету ЗАТЕ в повному обсязі направляються псу види федеральних, регіональних і місцевих податків й інші надходження, аккумулируемые на його території;
2) при недостатності власних і регульованих доходів бюджету ЗАТЕ виділяються з федерального бюджету дотації на фінансування витрат, пов’язаних з функціонуванням органів місцевого самоврядування. Розмір дотацій затверджується федеральним законом про федеральний бюджет на черговий фінансовий рік;
3) перевищення доходів над витратами бюджету ЗАТЕ не підлягає вилученню в бюджети інших рівнів бюджетної системи.
Виконання бюджету ЗАТЕ провадиться Федеральним казначейством РФ. Додаткові пільги по податках і зборам юридичним особам, зареєстрованим як налогоплательщиков у податкових органах ЗАТЕ, надаються органами місцевого самоврядування відповідних утворень за узгодженням з Мінфіном РФ.

12.2. Трансформація межбюджетных відносин
Принципи діючої в цей час системи межбюджетных відносин були створені в 1994 р. Вони забезпечили перехід від індивідуального узгодження обсягів фінансової допомоги суб’єктам РФ до єдиних правил її розподілу. Як основу для розрахунків бюджетні витрати 1991 р. використалися з наступним їхнім доведенням до року, прийнятого за базовий по доходах, але це привело до посилення суб’єктивізму при прийнятті конкретних рішень про обсяги фінансування.
До негативного можна також віднести наступні моменти: